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VMD中小技巧

发表评论 / AIMD / 作者: zg009 / 2024年4月29日

1.1、 如果设置了初始化设置,可以输入一下两个命令,就可以显示周期性原子 1.2、CP2K输出的原子轨迹文件 …

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CP2K2024.1安装

发表评论 / 软件相关 / 作者: zg009 / 2024年4月28日

1、本次安装用到系统的intel MKL,安装代码如下

VASP计算中能量和力的一些贡献相

发表评论 / 第一性计算 / 作者: zg009 / 2024年4月18日

1、能量的贡献相 alpha Z and the Ewald energy define the electr …

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slurm队列系统显示节点占用命令

发表评论 / 第一性计算, 软件相关 / 作者: zg009 / 2024年4月2日

sinfo -N -o “%C %R %N” 此命令会以节点的方式显示占用/空闲的核数 …

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lammps常用力场查询网站

发表评论 / lammps, 科研学习 / 作者: zg009 / 2024年3月5日

1、 NIST 2、SCM 3、LJ单位换算网站 4、LJ力场查找网站 其他参考:

删除PATH中不想要的环境变量

发表评论 / 脚本 / 作者: zg009 / 2024年2月29日

1、有时候系统会安装我们不需要或者冲突的环境变量,我们需要把他删除,如下

lammps计算声子谱

发表评论 / 科研学习, 软件相关 / 作者: zg009 / 2024年2月22日

1、创建conda环境,并激活 2、先完成lammps安装,可以参考这里,安装完成后编译链接文件 3、设置环境 …

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centos7 编译安装lammps

发表评论 / 科研学习, 软件相关 / 作者: zg009 / 2024年1月30日

1、先从官网下载最新的安装包 2、解压安装包 3、进入lammps的src目录,然后开始编译 4、设置环境变量 …

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使用MPAPI批量下载结构文件

发表评论 / 科研学习, 脚本 / 作者: zg009 / 2024年1月19日

1、需要安装Anaconda 2、然后确认pip3是不是在Anaconda中,然后就可以通过pip3 在自己用 …

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自动寻找晶面,并切晶面

发表评论 / 科研学习, 软件相关 / 作者: zg009 / 2024年1月16日

1、通过pymatgen软件包的XRD来分析晶格,寻找层间距最大的面 参考点这里 XRD的用法说明文章 2、A …

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